Forvaltningsrevisjonsavdeling II har ansvar for forvaltningsrevisjon av Finansdepartementet, Fiskeri- og kystdepartementet, Forsvarsdepartementet, Justis- og beredskapsdepartementet, Kulturdepartementet, Kunnskapsdepartementet, Landbruks- og matdepartementet, Miljøverndepartementet, Olje- og energidepartementet, Samferdselsdepartementet og Utenriksdepartementet.